Naučnici sada imaju više informacija o novom soju virusa SARS-CoV-2 koji se pojavio u Velikoj Britaniji.
Ova varijanta virusa ima nekoliko mutacija, a naučnici naglašavaju koliko su važni praćenje i genetsko sekvencioniranje virusa kako bi se ovakve stvari otkrile što je prije moguće.
Maria Van Kerkhove iz Svjetske zdravstvene organizacije izjavila je kako je nova varijanta pronađena i u Nizozemskoj, Australiji te Danskoj.
Ovaj je oblik, čini se, oko 70 posto zarazniji, a u Velikoj Britaniji su pooštrene mjere, dok su neke zemlje Europske unije suspendirale letove iz Britanije.
Naučnici iz nekoliko britanskih naučnih institucija, 19. novembra, izašli su s izvještajem o preliminarnoj genomskoj karakterizaciji novog soja virusa, koji nosi naziv B.1.1.7.
Ključne mutacije novog soja
Novi soj ima višestruke mutacije dijela genoma za “spike protein” virusa, od kojih ona koja je dovela do gubitka dvije aminokiseline iz “spike proteina” može olakšati njegovo širenje. Isto je uočeno u koronavirusima u nekoliko zemalja od proljeća, ali na niskim razinama. Mutacija je dobila zamah u južnoj Engleskoj tijekom augusta i septembra.
Pronađene su tri ključne mutacije B.1.1.7. varijante virusa koje uključuju mutaciju N501Y unutar domene koja veže receptor, a otkriveno je da povećava afinitet za vezivanje virusa na ACE2 kod ljudi i miševa. “N501Y” znači da je na poziciji 501 aminokiselina asparaginska kiselina (N) u proteinu zamijenjena s tirozinom.
Sljedeća mutacija je brisanje šiljka 69-70del, opisana u kontekstu izbjegavanje imunološkog odgovora čovjeka. Treća je mutacija P681H koja se nalazi neposredno uz mjesto cijepanja furina, poznato mjesto od biološkog značaja. Ova mutacija može pospješiti fuziju virusa s našim stanicama, piše VOA News.
Odakle se pojavila nova varijanta virusa?
Mutacija kojom je došlo do gubitka dvije aminokiseline otkrivena je kod pacijenta oboljelog od COVID-19 koji je imao oslabljeni imunološki sistem i koji je primao rekonvalescentnu plazmu. Taj tip biološke terapije – tretman COVID-19 pacijenata s krvnom plazmom osoba koje su preboljele istu bolest, pokazao se nedovoljno djelotvornim.
Svakako, moguće je i da je ova terapija ubrzala mutiranje virusa. Spomenuti pacijent kod kojeg je ustanovljena ova mutacija je preminuo, ali je virus mutirao.
Brzina mutiranja virusa povećala se nakon davanja plazme, ali ne i nakon davanja remdesivira, što bi moglo značiti da je plazma pojačala prirodnu selekciju virusa u smjeru nove mutacije. Treba naglasiti da je ovo za sad samo hipoteza koju će u budućnosti trebati dokazati.
Učinkovitost cjepiva
Eksperti tvrde da ova mutacija neće cjepiva učiniti neučinkovitima, za sada, iako nije isključeno da se to može jednom dogoditi. Trenutna cjepiva stvaraju različita antitijela koja neutraliziraju različite dijelove “spike proteina”, što ih čini učinkovitijim. Cjepiva se mogu poboljšati tako da budu učinkovita i na nove sojeve virusa.
Nova varijanta virusa koja se pojavila u Južnoafričkoj Republici slična je s britanskom varijantom u vidu spomenute N501Y mutacije, ali su genetski različite te se razlikuju u mnogim drugim mutacijama.